www.nationalcprassociation.com

Przemysław Płociński1,2,3 Maria Macios1 Joanna Houghton2 Emilia Niemiec1 Renata Płocińska3 Anna Brzostek3 Marcin Słomka4 Jarosław Dziadek3 Douglas Young2 Andrzej Dziembowski1,5

1Institute of Biochemistry and Biophysics, Polish Academy of Sciences, Pawińskiego 5A, Warsaw 02-106, Poland

2Mill Hill Laboratory, Francis Crick Institute, The Ridgeway, Mill Hill, London NW7 1AA, UK

3Institute of Medical Biology, Polish Academy of Sciences, Lodowa 106, Łódź 93-232, Poland

4Biobank Lab, Department of Molecular Biophysics, Faculty of Biology and Environmental Protection, University of Łódź, Pilarskiego 14/16, Łódź 90-231, Poland

5Institute of Genetics and Biotechnology, University of Warsaw, Pawińskiego 5A, Warsaw 02-106, Poland

 

 

Abstract

The phenotypic adjustments of Mycobacterium tuberculosis are commonly inferred from the analysis of transcript abundance. While mechanisms of transcriptional regulation have been extensively analysed in mycobacteria, little is known about mechanisms that shape the transcriptome by regulating RNA decay rates. The aim of the present study is to identify the core components of the RNA degradosome of M. tuberculosis and to analyse their function in RNA metabolism. Using an approach involving cross-linking to 4-thiouridine-labelled RNA, we mapped the mycobacterial RNA-bound proteome and identified degradosome-related enzymes polynucleotide phosphorylase (PNPase), ATP-dependent RNA helicase (RhlE), ribonuclease E (RNase E) and ribonuclease J (RNase J) as major components. We then carried out affinity purification of eGFP-tagged recombinant constructs to identify protein-protein interactions. This identified further interactions with cold-shock proteins and novel KH-domain proteins. Engineering and transcriptional profiling of strains with a reduced level of expression of core degradosome ribonucleases provided evidence of important pleiotropic roles of the enzymes in mycobacterial RNA metabolism highlighting their potential vulnerability as drug targets.

O nas

Poniżej znajdziecie Państwo wszystkie informacje o naszej działalności, kompetencjach,

kluczowych obszarach działalności i strukturze.

MISJA

Utworzenie Polskiej Sieci Biobanków zostało poprzedzone przystąpieniem do Europejskiego Konsorcjum Badawczego BBMRI-ERIC. Organizacja ta została powołana aby zagwarantować rozwój i kontrolowany dostęp do zasobów biobanków jednostkom akademickim i przemysłowym.  

#misja

STRUKTURA ORGANIZACYJNA

Konsorcjum BBMRI.pl w pierwszej fazie utworzyło 7 jednostek z terenu całego kraju, w dalszych fazach rozwoju - jesteśmy otwarci na chętnych do kierowania rozwojem biobankowania w Polsce.

#struktura

PARTNERZY

Struktura organizacyjna Konsorcjum BBMRI.pl:

 

Zapoznaj się ze składem jednostek budujących konsorcjum BBMRI.pl

#partnerzy

Blog/News

Tutaj znajdziecie Państwo wpisy z naszego BLOGA, w którym teksty skatalogowane

są wg. kategorii tematycznych.

BLOG/NEWS

Standardy jakości dla Biobanków Polskich…

15-05-2019

14 maja 2019 roku Zespół ds. Zapewnienia i Zarządzania Jakością Centrum Eksperckiego BBMRI.pl zaprezentował w grupie ekspertów WG6 BBMRI.QM service opracowane w ramach projektu „Infrastruktura Badawcza Biobanków i Zasobów Biomolekularnych...

Czytaj więcej

BLOG/NEWS

Raport ELSI dotyczący aspektów prawnych …

05-04-2019

Szanowni Państwo, Przedstawiamy pierwszy z raportów ELSI (Ethical, legal, societal implications) dotyczący aspektów prawnych biobankowania w Polsce opracowany przez dr Dorotę Krekorę-Zając w ramach zadania 6. Analiza aspektów etycznych, prawnych i społecznych biobankowania...

Czytaj więcej

Konferencje

Poniżej informacje na temat naszych spotkań, podczas których

dzielimy się wiedzą z dziedziny i zdobywamy doświadczenia.

Wydarzenia

Tutaj znajdziecie Państwo informacje o wydarzeniach i spotkaniach z dziedziny bio-danych.
Zapraszamy do zapoznania się z programem nadchodzących wydarzeń a także do rejestracji w ich udziale.
Prezentujemy także podsumowania spotkań i konferencji, które już miały miejsce.

Zbliżające się wydarzenie

Szkolenie ze Standardów Jakości dla Biob…

      Szkolenie ze Standardów Jakości dla Biobanków Polskich cz. I   18 czerwca 2019, Warszawski Uniwersytet Medyczny, Centrum Bioblioteczno-Informacyjne, ul. Żwirki i Wigury 63, sala 122 i 128, Warszawa  

Szczegóły..

Publikacje

Zapraszamy do zapoznania się z naszym katalogiem prac naukowych i artykułów

z dziedziny. Lista pozycji stale się powiększa.

Zagadnienia:

Publikacje

Pierwsza publikacja opisująca Audyty QMS…

06-05-2019

Realizatorzy projektu “Infrastruktura Badawcza Biobanków i Zasobów Biomolekularnych BBMRI-ERIC” opublikowali pracę, w której zaprezentowali wyniki audytów w zakresie Systemu Zapewnienia i Zarządzania Jakością w jednostkach konsorcjum BBMRI.pl. Praca została opublikowana...

Czytaj więcej

Publikacje

Identyfikacja podstawowych składników de…

30-04-2019

Gruźlica (TB) jest chorobą bakteryjną wywoływaną przez prątki Mycobacterium tuberculosis i mimo postępu medycyny w walce z nią, wciąż stanowi na świecie ogromny problem zdrowotny. W ostatnich latach nauka poczyniła duże postępy w badaniach proteomu i metabolomu M...

Czytaj więcej

Zespół

Zapraszamy do zapoznania się z informacjami na temat członków naszej drużyny.

Łukasz Kozera

 

Łukasz Kozera jest pomysłodawcą projektu Biobank Wrocławskiego Centrum Badań EIT+, a od 2013 r. Krajowym Koordynatorem ds. Biobankowania.

Więcej...

Anna Chróścicka

 

Anna Chróścicka jest biotechnologiem, absolwentką Wydziału Biologii Uniwersytetu Warszawskiego. 

Więcej...

Jakub Pawlikowski

 

Prof. Jakub Pawlikowski pracuje na stanowisku adiunkta w Zakładzie Etyki i Filozofii Człowieka Uniwersytetu Medycznego w Lublinie.

Więcej...

Leszek Kalinowski

 

Kierownik Zakładu Medycznej Diagnostyki Laboratoryjnej Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego, specjalista analityki klinicznej.

Więcej...

Katarzyna Ferdyn

 

Katarzyna Ferdyn jest expertem ds. SZiZJ i Audytorem Wiodącym na Uniwersytecie Medycznym im. Piastów Śląskich we Wrocławiu (UMW). 

Więcej...

Dorota Krekora-Zając

 

Adiunkt w Katedrze Prawa Cywilnego Porównawczego na Wydziale Prawa i Administracji Uniwersytetu Warszawskiego.

Więcej...

Małgorzata Lewandowska Szumieł

Prof. Małgorzata Lewandowska-Szumieł - Kierownik Laboratorium Badawczego - Banku Komórek Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego oraz Pracowni Inżynierii Tkankowej w Katedrze i Zakładzie Histologii i Embriologii WUM.

Więcej....

Dominik Strapagiel

 

Dominik Strapagiel jest expertem ds. Bezpieczeństwa Informacji i Kierownikiem Biobanku Łódź®️ Uniwersytetu Łódzkiego. 

Więcej...

Agnieszka Matera-Witkiewicz

Od roku 2015 pełni obowiązki Kierownika w Wydziałowej Pracowni Przesiewowych Testów Aktywności Biologicznej i Gromadzenia Materiału Biologicznego, Wydziału Farmaceutycznego, Uniwersytetu Medycznego we Wrocławiu. 

Więcej...

Jarosław Skokowski

Dr n. med. Jarosław Skokowski jest specjalistą z zakresu chirurgii ogólnej i  onkologicznej, absolwentem wydziału lekarskiego Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego.

Więcej...

Przydatne linki

Oto przedsiębiorstwa , instytucje i zespoły naukowe,

z którymi ściśle współpracujemy bądź wymieniamy się doświadczeniami

Kontakt

Jeśli macie Państwo do nas pytania zachęcamy do kontaktu

- za pośrednictwem e-maila, telefonu bądź formularza

umieszczonego poniżej

Drukuj
Contact Us
Feel free to contact us if you have any questions

Serdecznie zapraszamy do nawiązania z nami kontaktu.

Z przyjemnością odpowiemy na wszystkie Państwa pytania dotyczące naszej działalności, kompetencji, prowadzonych projektów naukowych. Chętnie dowiemy się też jakie są opinie Państwa na temat treści, jakie zamieszczamy na stronie.

 

Konsorcjum BBMRI.pl
Krajowy Ośrodek Wiodący
Sieć Badawcza Łukasiewicz
Polski Ośrodek Rozwoju Technologii
ul. Stabłowicka 147 (budynek 3),
54-066 Wrocław

mail: kontakt@bbmri.pl
www.bbmri.pl